Durante el currículo, se ofrecen franjas de asesoría por áreas del conocimiento, las cuales permiten que los estudiantes se concentren en sus proyectos y reciban el apoyo necesario. Esta división facilita incursionar en las particularidades de cada una de ellas en cuanto a la clase de problemas, metodologías y tipos de investigación.

Existen módulos presenciales con un enfoque teórico-práctico; cuatro encuentros interdisciplinarios, en los que se comparten los avances de los proyectos de investigación y otras franjas de asesorías individual, según el área de interés.

Las metodologías que se planifican y desarrollan en la Especialización en Docencia e Investigación Universitaria de la escuela de postgrados de la seccional Santa Marta, son metodologías activas, entre las cuales resaltamos:

Aprendizaje cooperativo; talleres; el aprendizaje basado en problemas y diversidad de estrategias dinámicas que se articulan, de acuerdo con las necesidades de cada grupo.
De otro lado, se acude a la enseñanza invertida, ya que el estudiante debe hacer unas lecturas previas antes de cada sesión y responder con éstas a unos interrogantes pedagógicos. Esta metodología permite que tanto los docentes como los estudiantes generen interacción, desde antes del inicio de cada sesión y así mantener procesos de aprendizaje interactivos.